Ich habe ein externes Festplatten-Gehäuse, das über USB Übertragungsraten von 35MB/s erreichen. Vor einigen Jahren war man noch froh, diese Geschwindigkeit über USB zu erreichen. Es ist also nicht so, daß USB grundsätzlich langsam ist, auch wenn ich davon ausgehe, daß die gleiche Platte direkt angeschlossen etwas doppelt so schnell wäre. Das ist allerdings auf einem richtigen PC. Es heißt ja, daß schon die USB-Controller auf den PCs viel CPU Zeit brauchen, was aber mit einer leistungsfähigen CPU nicht so wild ist. Die CPU in der Box ist auf jeden Fall schwächer, und möglicherweise ist der USB-Controller dort auch nur ein programmierter Logik-Chip und nicht ein speziell dafür entwickelter Chip.
In der ursprünglichen Frage wurde dann auch nicht nur die reinen USB Übertragungsgeschwindigkeit genannt, sondern in Verbindung mit einem Dateisystem und einem Netzwerkzugang, was mit USB zunächst wenig zu tun hat und dann auch noch Faktoren wie Fragmentierung des Dateisystems mit ins Spiel bringt.
Das macht die Vergleichbarkeit noch schwerer. Speziell ist bekannt, daß Samba recht CPU-lastig ist.