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Das war ja das fiese an dem Fehler, dass alle Nummern als registriert in der Übersicht erschienen...
Aber wenn du bei der 2. Nummer den richtigen Benutzernamen, (nämlich Vorwahl+Rufnummer), eingetragen ist, dann liegt dein Problem doch woanders.
Wenn Wahlregeln in der Fritzbox vorliegen (der LCR ist nichts anderes Als ein System von Wahlregeln), dann werden die in den Nebenstellen konfigurierten abgehenden MSN gegebenenfalls "überschrieben". Im LCR (wie auch in den Wahlregeln) kannst Du bei VOIP den Provider mit einer MSN auswählen, das gilt dann für alle Nebenstellen.
Lösung: Nimm die Inlandszonen Festnetz aus der Konfiguration des LCR heraus: keine Wahlregeln für diese Zonen --> abgehende MSN wird nebenstellenabhängig per VOIP genützt (Die Fritzbox bevorzugt immer VOIP, wenn ohne Wahlregel eine VOIP-MSN in der wählenden Nebenstelle konfiguriert ist).