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Was du verstehen musst:
1. Der interne Speicher wird für FTP und NAS immer benötigt, weil...
2. ...die Aufsetzpunkte (mountpoints) für alle anderen Freigaben in diesem erstellt werden.
3. Deaktiviere ihn, indem alle anderen Häkchen weggenommen werden (USB, Onlinespeicher).
4. Dann will die Fritz!Box einen Neustart. NAS ist dann deaktiviert.
...allerdings seh ich noch ein oder im Hinweistext.
Versuch macht klug, probiers mal aus.